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CRISPR/Cas9:基因敲除細胞系構建服務

 

賽爾瑞成采用CRISPR/Cas9系統(tǒng),提供基因敲除細胞系構建服務。賽爾瑞成根據目的基因序列設計合成sgRNA,將Cas9和sgRNA基因轉染目的細胞,進而敲除目的基因,并進行單克隆篩選,獲得基因敲除單克隆細胞系。

 

 

CRISPR/Cas9系統(tǒng)作為新一代基因編輯工具,因其構建方便、設計靈活,操作簡單、效率高成本低,成為基因敲除的新一代利器。該系統(tǒng)由有DNA切割活性Cas9蛋白和識別特異靶點的sgRNA組成。Cas9是一種核酸內切酶,它和sgRNA構成的復合體能與DNA分子上的特定序列結合,并在PAM序列(幾乎存在于所有基因)上游切斷DNA雙鏈。DNA被切斷后,細胞會啟動DNA損傷修復機制,造成基因的缺失、移碼、插入等隨機突變模式,達到修復雙鏈斷裂的目的,同時造成靶向基因敲除。

CRISPR/Cas9:穩(wěn)定細胞系構建服務流程

內容

詳細信息

服務周期

gRNA 設計合成及載體構建

gRNA 設計及合成 、載體構建、質粒測序及制備

2-3

轉染

慢病毒侵染

2-3

單克隆細胞制備

單克隆細胞稀釋培養(yǎng)、篩選、PCR鑒定、獲得基因敲除單克隆細胞株

5-8

鑒定

測序鑒定

2-3

送貨

提供項目COA、穩(wěn)定克隆

 

 

案例展示:
1.構建慢病毒載體的crispr sgRNA的單質粒系統(tǒng)。
2.經過293T細胞轉染,包裝得到慢病毒。
3.通過慢病毒轉導的方式感染目的細胞。
4.通過抗生素篩選和單克隆挑取后,擴大培養(yǎng)。
5.經挑取單克隆細胞后,提取得到單克隆細胞的基因組DNA,再通過PCR擴增目的基因編輯位點的上下游區(qū)段,經過TA克隆連接到PMD19T的載體上,進行測序驗證,選取10個菌落測序鑒定得到單克隆的細胞是否單一。
下圖是交付給客戶的單克隆細胞驗證結果:

 

T7E1酶切法突變體檢測試驗檢測CRISPR/Cas9的編輯效率:
賽爾瑞成采用T7E1酶切法突變體檢測試驗檢測CRISPR/Cas9的編輯效率。若sgRNA有效編輯了基因組DNA,則目的基因在修復后會出現堿基缺失突變現象,通過分析T7E1酶處理目標DNA片段的雜合鏈后的情況,從而驗證Cas/sgRNA的編輯效率,用于篩選編輯效率高的sgRNA。

 

 

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