賽爾瑞成采用CRISPR/Cas9系統(tǒng),,提供基因敲除細胞系構建服務。賽爾瑞成根據目的基因序列設計合成sgRNA,,將Cas9和sgRNA基因轉染目的細胞,進而敲除目的基因,,并進行單克隆篩選,,獲得基因敲除單克隆細胞系。
CRISPR/Cas9系統(tǒng)作為新一代基因編輯工具,,因其構建方便,、設計靈活,操作簡單,、效率高成本低,,成為基因敲除的新一代利器。該系統(tǒng)由有DNA切割活性Cas9蛋白和識別特異靶點的sgRNA組成,。Cas9是一種核酸內切酶,,它和sgRNA構成的復合體能與DNA分子上的特定序列結合,并在PAM序列(幾乎存在于所有基因)上游切斷DNA雙鏈,。DNA被切斷后,,細胞會啟動DNA損傷修復機制,造成基因的缺失,、移碼,、插入等隨機突變模式,達到修復雙鏈斷裂的目的,,同時造成靶向基因敲除,。
CRISPR/Cas9:穩(wěn)定細胞系構建服務流程
內容 |
詳細信息 |
服務周期 |
gRNA 設計合成及載體構建 |
gRNA 設計及合成 、載體構建,、質粒測序及制備 |
2-3 周 |
轉染 |
慢病毒侵染 |
2-3 周 |
單克隆細胞制備 |
單克隆細胞稀釋培養(yǎng),、篩選、PCR鑒定,、獲得基因敲除單克隆細胞株 |
5-8 周 |
鑒定 |
測序鑒定 |
2-3 周 |
送貨 |
提供項目COA,、穩(wěn)定克隆 |
|
案例展示:
1.構建慢病毒載體的crispr sgRNA的單質粒系統(tǒng)。
2.經過293T細胞轉染,,包裝得到慢病毒,。
3.通過慢病毒轉導的方式感染目的細胞。
4.通過抗生素篩選和單克隆挑取后,,擴大培養(yǎng),。
5.經挑取單克隆細胞后,提取得到單克隆細胞的基因組DNA,,再通過PCR擴增目的基因編輯位點的上下游區(qū)段,,經過TA克隆連接到PMD19T的載體上,進行測序驗證,選取10個菌落測序鑒定得到單克隆的細胞是否單一,。
下圖是交付給客戶的單克隆細胞驗證結果,。
T7E1酶切法突變體檢測試驗檢測CRISPR/Cas9的編輯效率:
賽爾瑞成采用T7E1酶切法突變體檢測試驗檢測CRISPR/Cas9的編輯效率。若sgRNA有效編輯了基因組DNA,,則目的基因在修復后會出現(xiàn)堿基缺失突變現(xiàn)象,,通過分析T7E1酶處理目標DNA片段的雜合鏈后的情況,從而驗證Cas/sgRNA的編輯效率,,用于篩選編輯效率高的sgRNA,。